中华绒螯蟹(Eriocheir japonica sinensis)线粒体ND5基因序列变异分析

摘要

不同水系河蟹已发现严重混杂,水产业中急需一种快速鉴别不同水系的分子标记.基于研究13条长约853bp的线粒体ND5基因序列分析得出,其平均碱基组成为40.2 % A,30.9% T,9.2% G,19.7% C,共定义了8个单元型,单元型多样性(h)为0.885;序列间存在16个变异位点,核苷酸多样性(π)为0.004;平均遗传距离为0.004.其中单元型EJSⅠ和EJSⅡ占据了53.8%的个体数量,推测可能是较为原始类型;两单元型在NJ和UPGMA系统发生树中分居于不同的分支,可能蕴涵着各自进化历史.通过研究表明,ND5序列的变异水平将为采用PCR-RFLP或位点特异性PCR等分子标记分辨不同水系河蟹起着重要作用.