Pla a 1序列分析及三维结构建模

摘要

联合运用多种方法预测Pla a 1的亲水性及其二级结构,利用同源建模法建构Pla a 1的三维结构模型,在nb数据库中进行BLAST并构建同源进化树,在Scan Prosite数据库中进行Motif预测,对Pla a 1进行序列分析并进行三维结构建模.该蛋白是一个主要为α+β结构的亲水性蛋白,预测其具有一个蛋白激酶C的磷酸化位点,一个N豆蔻酰化位点和三个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点.Pla a 1具有较强的信号转导作用,且与拟南芥的果胶(甲)酯酶抑制剂在进化上具有较近的亲缘关系;所预测的三维结构基本能反映出Pla a 1真实的空间构象,这将为今后进一步理解和掌握Pla a 1结构和功能上的关系打下理论基础.