单链环状DNA添加剂抑制基因表达序列分析Ditag聚合酶链反应引物多聚体生成

摘要

[目的]研究利用单链环状DNA抑制聚合酶链反应(PCR)副产物的作用效果.[方法]设计并合成单链环状DNA,并以具同样序列发卡状结构的单链DNA为对照组,在基因表达序列分析(SAGE)Ditag PCR反应中加入上述不同浓度的DNA,利用电泳技术检测不同结构(环状/单链)以及不同浓度单链DNA对PCR多聚体附产物的抑制作用.[结果]发卡状结构的单链DNA无法抑制PCR引物多聚体副产物的产生;而在70 ～ 150 nmol/L终浓度范围内,单链环状DNA可以抑制SAGE Ditag PCR反应中引物多聚体的生成,并且不影响SAGE不同tag间的表达丰度差异.[结论]单链环状DNA可以作为PCR反应中引物多聚体生成的有效抑制剂.