二穗短柄草MADS-BOX基因AGL6和FUL1的可变拼接和表达模式分析

摘要

MADS-BOX基因家族是一类调控植物发育的重要转录因子,AGAMOUS LIKE 6(AGL6)和FRUITFULL(FUL1)属于其亚家族.本研究克隆了二穗短柄草(Brachypodium distachyon)2个MADS-BOX基因BdA GL6和BdFUL1的cDNA序列,分析了这2个基因的可变拼接和表达模式.结果表明,BdA GL6基因在转录过程中,由于内含子部分保留机制,发生可变拼接,形成了3个转录本(BdAGL6-1、BdAGL6-2和BdAGL6-3); BdAGL6-3与水稻(Oryza sativa)、玉米(Zea maize)等禾本科植物中的AGL6转录因子序列高度同源;和BdAGL6-3相比,BdAGL6-1在C末端结构域插入额外的7个氨基酸;BdAGL6-2在C末端结构域插入额外的5个氨基酸.qRT-PCR结果显示,BdA GL6在花中高水平表达,其中BdAGL6-3表达最强,BdAGL6-1和BdA GL6-2表达较弱.BdFUL1基因的前体mRNA同样发生了可变拼接,产生2个转录本(BdFUL1-1和BdFUL1-2);两者的表达模式相似,除了在花和茎中表达之外,在幼苗的叶中也有表达.研究结果为进一步了解MADS-BOX基因家族的生物学功能提供了参考资料.