贵州白山羊SIRT1基因组织表达及其多态性与血清脂代谢指标的关联性分析

摘要

沉默信息调节因子1(silent mating type information regulation 2 homolog 1,SIRT1)通过去乙酰化参与脂肪动员、影响脂肪代谢。为探究贵州白山羊(Capra hircus)中SIRT1基因多态性,并筛选与贵州白山羊血清脂代谢指标相关的SNP位点,本研究对SIRT1进行生物信息学分析,分析SIRT1基因在各组织中的表达情况及SNPs与血清中胆固醇、甘油三酯和游离脂肪酸的关联性。结果显示,SIRT1基因在11个组织中均有表达,其中肝脏、背最长肌中的表达量极显著高于其他组织(PC、g.21206920T>G、g.21207071A>C、g.21215871G>A、g.21216960T>C、g.21217717T>C和g.21217777A>G位点PIC均处于中度多态水平,g.21207042C>T、g.21217404T>C突变位点群体基因遗传平衡偏离Hardy-Weinberg平衡状态(PC、g.21206920T>G、g.21207071A>C、g.21215871G>A、g.21216960T>C、g.21217717T>C、g.21217777A>G位点之间,g.21207042C>T、g.21217404T>C两个位点之间互相存在强连锁不平衡效应;生物信息学分析可知,该蛋白质分子式为C3514H5530N968O1153S26,系非跨膜蛋白,有3个N-糖基化位点,二、三级结构主要以无规则卷曲结构占比最高。g.21206920T>G、g.21207071A>C、g.21216060C>A、g.21216960T>C位点突变后最小自由能不变,其他位点均发生改变。关联性分析发现,g.21206920T>G和g.21217777A>G位点处胆固醇、甘油三酯和游离脂肪酸含量在不同基因型之间差异显著(PC、g.21216960T>C和g.21217717T>C位点处胆固醇、游离脂肪酸含量在不同基因型之间差异显著(PC位点处甘油三酯和游离脂肪酸含量在不同基因型之间差异显著(PA位点处不同基因型之间差异显著(P<0.05)。本研究结果表明,SIRT1基因可作为贵州白山羊脂肪代谢与沉积的候选分子标记,为明确SIRT1基因调控脂肪代谢的相关位点和开展山羊遗传标记提供了理论参考。