短链脱氢酶超家族介导植物次级代谢研究进展

摘要

短链脱氢酶超家族是一类古老而庞大的NAD(P)(H)依赖的氧化还原家族,参与催化多个初生代谢与次生代谢反应过程.迄今,在生物界中已发现短链脱氢酶家族成员超47000个.序列比对显示,该家族个体间相似性较低,但都含有特征性的"Rossmann-fold"保守结构.为快速鉴别和研究短链脱氢酶功能,研究者在国际上发展了一套隐马尔可夫模型和命名分类系统,专门的数据库SDR Enzymes亦构建完成.近年来,随着基因组数据的陆续公布,植物短链脱氢酶家族成员呈爆发式扩增.相关研究结果显示,植物基因组中含短链脱氢酶数量60～350个不等,根据序列特征可细分为5大类,参与约50种不同的代谢路径.本文从介绍短链脱氢酶隐马尔可夫模型、命名分类系统及序列特征等出发,重点对近年来植物短链脱氢酶家族次级代谢功能研究结果进行总结,旨在为进一步深入开展相关研究提供信息参考.