2018—2019年漳州市诺如病毒暴发疫情的分子流行病学特征

摘要

目的:分析2018—2019年漳州市诺如病毒暴发疫情的分子流行病学特征。方法:选取2018年2月至2019年10月漳州市16起聚集性胃肠炎疫情中的114例疑似病例作为研究对象。收集研究对象粪便、带便肛拭子或呕吐物标本，采用荧光定量PCR方法对标本进行诺如病毒基因检测，GⅡ组阳性样本进一步用普通RT-PCR方法对部分聚合酶区（RdRp）-衣壳区（VP1）进行基因扩增，阳性标本进行测序并做系统进化分析。结果:16起聚集性胃肠炎疫情中，11起诺如病毒检测阳性。114例疑似病例中，实验室确诊55例，阳性率为48.25%。其中，GⅡ组48例，GI组1例，GI组和GⅡ组同时阳性的6例；男性40例（72.73%，40/55）,女性15例（27.27%，15/55）；14岁以下儿童43例，占78.18%（43/55）；幼儿园及中小学为主要暴发场所（9/11）；季节高峰主要在2—3月及9—12月（10/11）。测序共获得来自8起聚集性疫情中的27份标本序列，系统发育树构建结果显示有4种GⅡ组基因型，包括15株GⅡ.2[P16]、2株GⅡ.4Sydney[P31]、4株GⅡ.17[P17]和6株GⅡ.3[P12]。结论:诺如病毒是引起漳州市聚集性胃肠炎的常见病原体，其中GⅡ.2[P16]变异株为本地区优势流行株。