UGT2A3差异表达在结直肠癌发生和早期诊断中的作用机制

摘要

目的研究UDP-葡萄糖醛酸糖基转移酶（UGT）家族成员UGT2A3的差异表达在结直肠癌（CRC）发生中的作用及调控机制。方法从高通量基因表达（GEO）数据库和癌症基因组图集（TCGA）中共下载了9个CRC数据集。采用R语言分析UGT2A3在CRC组织和癌旁正常组织中的差异表达情况。在TCGA中根据UGT2A3的表达水平,在所有样本、正常组织、癌组织样本中分别选取表达最高和最低的前20例样本,比较免疫细胞丰度和免疫富集评分;筛选差异表达基因和差异表达miRNA,并进行差异表达基因的通路富集分析。结果 UGT2A3在所有9个数据集的CRC组织中均明显下调。与UGT2A3高表达组相比,UGT2A3低表达组的ImmuneScore、EstimateScore和StromalScore得分明显较高,且免疫细胞丰度较高（记忆B细胞除外）。在正常组织中,UGT2A3的差异表达主要影响癌症相关通路,而在CRC组织中主要影响代谢途径。miR-194-2、miR-224和miR-551b在所有分组中均显著差异表达,其被认为是CRC中潜在的UGT2A3上游调控基因。结论 UGT2A3、miR-194-2、miR-224和miR-551b可作为CRC潜在的诊断生物标志物。