新型抗癌药物多西他赛与β-微管蛋白作用位点的初步研究

摘要

目的研究抗癌药物多西他赛（DTX）与β-微管蛋白的作用机制,确定两者的结合位点及发生相互作用的氨基酸残基,分析两者结合的动态作用过程。方法采用分子对接法计算势能面上不同结构的DTX分子与β-微管蛋白的对接结合能和相互作用位点;运用分子动力学方法模拟结合能较低的DTX与β-微管蛋白络合物的动态作用过程。结果分子对接模拟结果显示,DTX分子与β-微管蛋白的作用位点有3处（N1、N2和N3）,选择位于N2位点对接结合能优异的DTX分子（1、2和4号结构）进行分子动力学模拟,得到了体系络合物从非平衡到平衡的动态变化作用过程。其中1号结构DTX在动力学模拟过程中形成的氢键数目明显高于2号和4号结构;1、2和4号结构DTX的溶剂可及表面积亦普遍高于紫杉醇。结论建立了DTX与β-微管蛋白的结合作用模型,为新型紫杉醇类抗癌药物的设计和开发了提供理论指导。