枯草期放牧东宝黑头羊瘤胃内环境参数及瘤胃细菌多样性分析

摘要

试验旨在研究枯草期放牧东宝黑头羊瘤胃内环境参数及瘤胃细菌多样性.采集枯草期牧草样品,测定常规营养成分含量,选取6只体重为(45.24±1.25)kg的2岁全年放牧的东宝黑头羊(公母各半),进行耳牌标记,在枯草期放牧前空腹经口腔采集瘤胃液,用于分析瘤胃内环境参数和瘤胃细菌多样性.结果表明,东宝黑头羊瘤胃液pH为6.65,氨态氮(NH3-N)浓度50.30 mg/L,乙酸/丙酸4.43;6个样本共获得290868条高质量16S rDNA序列,479.67个分类操作单元(OTU),东宝黑头羊瘤胃细菌丰富度指数Ace指数、Chao1指数分别为523.31、533.79,α-多样性指数Shannon指数、Simpson指数分别为6.39、0.96;经物种注释,共有15个门23个纲29个目34个科87个属被鉴定.在门水平,拟杆菌门(Bacteroidetes,75.75％)、厚壁菌门(Firmicutes,15.62％)含量最多;在科水平,主要包括理研菌科(Rikenellaceae,45.89％)、普雷沃氏菌科(Prevotellaceae,19.18％);在属水平,理研菌科RC9肠道群(Rikenellaceae_RC9_gut_group,45.64％)、普雷沃氏菌属(Prevotella_1,15.46％)是放牧东宝黑头羊瘤胃中的优势种群.结果证明,枯草期放牧东宝黑头羊瘤胃细菌多样性较低;乙酸/丙酸比值较高;东宝黑头羊瘤胃中最优势菌门为拟杆菌门,其次是厚壁菌门;理研菌科RC9肠道群是东宝黑头羊瘤胃中最优势细菌属.