五指山猪IGF2基因5'调控区单核苷酸多态性分析

摘要

利用PCR产物直接测序法,对五指山猪、滇南小耳猪、香猪、梅山猪和大白猪共60个样本的IGF2基因5'调控区部分片段的单核苷酸多态性进行了研究.找到13个SNP,分别是:C5872T、C5888T、A5976G、C6010T、T6029A、C6037T、C6043T、C6063T、C6112T、C6164T、G13520A、G13563A和G13669A.T6029A为T(→←)A碱基颠换,A5976G、G13520A、G13563A和G13669A为A(→←)G转换,其他均为C(→←)T转换.针对13个SNP位点得到23种组合基因型.统计各位点等位基因和基因型以及各组合基因型在总群体与各品种内的分布频率,发现3个小型猪在A5976G、C6164T和G13669A位点上的优势等位基因均分别为G、T和A,而梅山猪和大白猪的优势等位基因均分别为A、C和G;H19型为3个小型猪的特征组合基因型,而另两个猪品种为H15型.同时对123头五指山猪IGF2基因C5888T位点进行了PCR-RFLP分析,研究表明该位点C为优势等位基因(0.8536),CC为优势基因型(0.7235).卡方检验表明该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态.这些结果可为五指山猪等小型猪的生长发育规律、矮小机制等方面的研究提供遗传学依据.