十字花科植物SAMDC基因同源序列的克隆与进化分析

摘要

腺苷甲硫氨酸脱羧酶(SAMDC)是参与植物多胺合成的一个关键酶.根据GenBank中已报道的SAMDC基因编码序列保守区域设计特异引物,运用PCR技术分别从十字花科6属14个物种中新克隆分离了SAMDC基因的同源序列.比较分析结果表明:这些同源序列的相似性达87%以上,所推导的氨基酸序列相似性达90%以上,且两者种间差异分别为0.2%～10.1%和0.3%～6.6%,属间差异除"圆白"萝卜外分别是4.9%～13.6%和3.1%～10.3%;SAMDC基因的核苷酸及其可能编码的氨基酸序列差异属间较种间大,可用于属间的分类等级研究;且氨基酸序列间的差异比核苷酸序列间的差异小的多,因而根据核苷酸序列构建了NJ与ME分子系统树.进化树直观地表明在亲缘进化关系上芸薹属与萝卜属较近,其他依次为山芥属、蔊菜属、拟南芥属,与荠菜属最远.研究结果有助于从分子水平阐明十字花科植物间的亲缘进化关系,可为其种质资源利用提供理论依据.