向日葵HaKAR1基因的生物信息学和表达分析

摘要

KAR编码β-酮脂酰-ACP还原酶,是在脂肪酸合成过程中催化酮脂酰还原反应的酶.为了解向日葵HaKAR1基因的表达特性及功能,对向日葵HaKAR1编码蛋白进行生物信息学分析和基因表达模式分析,预测HaKAR1编码蛋白为碱性蛋白且为亲水性蛋白,蛋白二级结构主要为α螺旋,预测亚细胞定位于叶绿体.系统进化分析发现,HaKAR1与莴苣(Lactuca sativa L.)KAR1进化关系最近,序列相似性高达90％.基因表达模式分析发现,HaKAR1在向日葵种子、舌状花和管状花中表达量较高,其次为茎、叶,在根中不表达.HaKAR1在高、低油酸向日葵种子开花后7～27 d表达均呈先上升后下降再上升的趋势,但在开花后37 d,低油酸材料种子中表达量明显高于高油酸材料,表明HaKAR1在高、低油酸种子发育后期可能存在不同表达调控机制.