玛瑙红樱桃病毒病小RNA的高通量测序检测

摘要

为玛瑙红樱桃病毒病的防治与控制提供参考,采用第2代测序技术对玛瑙红樱桃黄化叶片进行小RNA测序,利用Velet对获得的小RNA进行组装,再将得到的重叠群(contigs)与数据库比对寻找其中的病毒序列.结果 表明:贵州省玛瑙红樱桃纳雍县样本中的候选病毒库中,樱桃小果病毒2比对到的reads有6 014条,占总参考序列mapped reads的75.62％,其樱桃产区存在樱桃小果病毒2;在福泉、六枝产区未检出.贵州省玛瑙红樱桃部分产区存在病毒病,病原较单一,部分产区樱桃黄化症状不是由病毒引起.