山西省酸枣遗传多样性及遗传结构分析

摘要

[目的]山西省是我国酸枣集中分布区之一,开展山西省酸枣遗传多样性研究,为酸枣种质资源保护及可持续利用奠定基础.[方法]本研究利用生物信息学方法筛选酸枣中单拷贝核基因标记,对山西省14个酸枣居群的遗传多样性、遗传结构及居群动态进行分析.[结果]本研究筛选得到6个单拷贝核基因标记用于开展山西省酸枣种质资源相关研究.单拷贝核基因标记的长度为199～846bp,分离位点数目和单倍型多样性平均值分别为37和0.857,表明单拷贝核基因标记多样性较高.中性检验表明:所有单拷贝核基因标记均符合中性进化假设.山西省酸枣表现出产高的遗传多样性(π=0.007 20,θw=0.009 25),这与高度异交及居群历史动态有关.失配分布分析表明:山西省酸枣在进化历史上经历过居群持续扩张,这与黄土高原地区受第四纪冰期循环影响小有关.STRUCTURE分析表明:山西酸枣居群没有形成明显的遗传结构.AMOVA分析显示:居群间遗传分化水平较高(Fst=0.145),居群内变异是总变异的主要来源(85.48％).Mantel test表明:遗传距离和地理距离之间没有相关性(r=0.177 5,P=0.216.).[结论]单拷贝核基因标记可以应用于酸枣种质资源遗传学研究.山西省酸枣种质资源遗传多样性水平较高,居群间遗传分化较明显.