基于转录组学的多组学分析腐败希瓦氏菌冷适应的机制

摘要

该文基于转录组(high-throughput transcriptome sequencing,RNA-seq)分析腐败希瓦氏菌(Shewanella putrefaciens)ATCC8071在低温下基因表达的差异性。结果表明,在低温条件下,S.putrefaciens中2142个基因的表达具有明显差异,其中对S.putrefaciens低温冷适应机理起重要的作用基因大量集中于脂肪酸代谢、能量代谢相关通路中。进一步对S.putrefaciens差异基因联合低温条件下脂质组学与蛋白组学数据进行分析,结果表明,在低温下S.putrefaciens基因的差异在不同基因表达层面都表现出明显的一致性,表明脂肪酸代谢与能量代谢的改变对S.putrefaciens冷适应贡献的机制。