206株中国环境分离嗜肺军团菌1型菌株基因序列分型研究

摘要

目的 对中国不同自然环境来源分离的嗜肺军团菌血清1型菌株进行分子分型和种群结构分析.方法 应用7个基因(flaA、pilE、asd、mip、mompS、proA、neuA)序列分型方法(Sequence based typing,SBT)对不同环境来源的206株嗜肺军团菌血清1型菌株进行分型研究,通过查询嗜肺军团菌SBT数据库(http://www.ewgli.org)和用BioNumerics软件构建最小生成树揭示菌株的分子分型和种群结构特征.结果 206株菌分成54个ST型(IOD =0.7205).其中49株温泉水分离株分成25个ST型(IOD=0.9498),各位点Nei指数0.7721 ～ 0.8563;130株冷却塔水分离株分成31个ST型(IOD =0.6453),各位点Nei指数为0.4227 ～0.4970;27株管道水分离株分成3个ST型(IOD=0.1453),各位点Nei指数为0.1425 ～0.1453.ST1型含108株菌,占52.4％,是优势带型.54个ST型形成5个克隆群.通过中国菌株和其他20个国家的菌株综合分析,共计1199株菌分成304个ST型,形成21个序列群.其中ST-1型为全球优势型别,其余型别和序列群呈地区性分布特征.结论 中国环境分离的嗜肺军团菌1型菌株具有高度复杂的基因多态性和种群结构,其中ST1是我国也是全球环境菌株的优势型别.