新型冠状病毒全球主要流行株基因组变异变迁分析

摘要

基于Pango命名法,全球曾经或正在流行的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)亚型或分支已有1379个(截至2021年9月20日).由于传播力、免疫逃逸能力更强的变异株逐渐成为绝对优势流行株,很多基因型别已经消失或接近消失.世界卫生组织定义了4种关切变异株、5种关注变异株和11种需进一步监测的变异株.目前,Delta变异株取代Alpha变异株成为全球优势流行毒株,也是近期我国输入病例和导致输入关联本土疫情的主要毒株.同时,在南美洲部分国家流行的Gamma和Lambda变异株,在南美洲和北美洲部分国家流行的Mu变异株,以及在南非流行的C.1.2变异株,同样引起全球的高度关注.本研究对SARS-CoV-2基因组的变异变迁、重要变异株的研究进展进行综述,并结合SARS-CoV-2变异株的流行现状提出了下一步科学研究关注的要点.