2017-2019年度上海市松江区A(H1N1)pdm09流感病毒HA和NA基因特征分析

摘要

目的 分析上海市松江区2017-2019监测年度A(H1N1)pdm09流感病毒HA和NA基因特征.方法 对松江区分离的毒株随机挑选46株A(H1N1)pdm09流感病毒毒株进行HA和NA基因序列进化分析和氨基酸位点变异分析,采用神经氨酸酶抑制实验开展奥司他韦和扎那米韦敏感性监测.结果 A(H1N1)pdm09流感病毒属于6B.1A分支且进化出了 6B.1A2、6B.1A5A和6B.1A6进化簇.核苷酸序列分析显示,HA和NA基因与WHO推荐的2019-2020年度的疫苗株A/Brisbane/02/2018的亲缘关系较为接近,同源性分别为98.6％～99.4％和99.1％～99.7％.氨基酸序列分析显示,HA1蛋白共有23个位点发生氨基酸序列变异,43.48％病毒发生位于抗原决定簇Cb、Sa和Sb区的S74R、S164T、T185I共同突变,提示病毒发生抗原漂移.鸡胚适应性分析发现HA蛋白D187V、Q223R和E224K位点的适应性突变.NA蛋白共有25个位点发生变异,存在酶活性中心E1 19K(2/46)突变.神经氨酸酶抑制实验显示,所测流感病毒对奥司他韦和扎那米韦均敏感.结论A(H1N1)pdm09流感病毒HA和NA基因及其编码的氨基酸持续变异,因此应持续监测流感病毒,为科学防控提供依据.