华南沿海长鳍篮子鱼不同地理群体的遗传多样性分析

摘要

为探明华南沿海长鳍篮子鱼(Siganus canaliculatus)不同地理群体遗传多样性与遗传分化状况,采用线粒体控制区(D-loop)基因序列分析华南沿海厦门(XM)、汕尾(SW)、阳江(YJ)、海口(HK)、三亚(SY)、北海(BH)、钦州(QZ)、防城港(FC)以及越南清化(TH)9个地理位置长鳍篮子鱼群体的遗传多样性及群体遗传结构。结果显示,长鳍篮子鱼群体DNA D-loop序列共计484条,序列长度约828 bp,包含57个变异位点,92个单倍型;所有群体总的单倍型多样性指数(H_(d))为0.80798,核苷酸多样性指数(π)为0.00405;群体内遗传距离为0.00386~0.00532,群体间遗传距离为0.00383~0.00482,群体间分化指数为-0.01935~0.00759,各种分组的AMOVA分析均显示遗传变异全部来自群体内;Fu’s Fs检验值为显著负值(-25.53678,P<0.01),核苷酸错配分布图呈单峰,吻合度检验数值较小且不显著,提示长鳍篮子鱼可能经历过种群扩张事件,推测扩张时间距今1.18万~4.74万年。研究表明,南海北部沿岸及东海南部9个长鳍篮子鱼地理群体间不存在显著的地理结构和谱系结构,可划归一个管理单元进行种质资源保护。