脐橙早熟芽变及其早熟性状回复型材料的AFLP和MSAP分析

摘要

【目的】探究不同成熟期的脐橙在基因组、甲基化修饰水平和变异模式方面的差异,为挖掘早熟性状分子标记,探讨脐橙早熟芽变性状与DNA甲基化的关系及早熟性状相关候选基因的筛选奠定基础。【方法】以纽荷尔脐橙、纽荷尔早熟芽变品种赣南早脐橙及赣南早的早熟性状回复型突变体(性状回复型)为试材,采用扩增片段长度多态性技术(amplified fragment length polymorphism,AFLP)和甲基化敏感扩增多态性分析(methylation sensitive amplification polymorphism,MSAP)对其在基因组、甲基化修饰水平和变异模式方面的差异与脐橙早熟性状之间的关系进行探究。【结果】采用AFLP与MSAP技术均发现较多多态性条带,其中AFLP的多态性占比(5.5046%~5.5556%)高于MSAP(1.3699%~3.2110%),发现7对引物共8条多态性条带与脐橙熟期性状共分离。试材DNA甲基化发生频率为13.7614%~16.8182%,平均14.9116%,全甲基化为主要的甲基化方式。试材超甲基化发生频率显著高于去甲基化发生频率,性状回复型果实熟期回复推测与CHG去甲基化相关。【结论】在基因层面证明性状回复型为赣南早的回复型突变体。脐橙果树在形成不同熟期芽变材料过程中,基因组DNA的超甲基化与去甲基化同时发生,但以超甲基化为主。本研究为进一步阐明脐橙果实熟期性状的发生发展机制提供指导。