一个AA基因组特异的串联重复序列的克隆及其在中国普通野生稻和栽培稻中的分化特征

摘要

从籼稻（ＯｒｙｚａｓａｔｉｖａＬ．ｓｐｐ．ｉｎｄｉｃａ）“窄叶青”中克隆到了１个重复序列（ｐＯｓ１３９）。经分子杂交证明，ｐＯｓ１３９为一稻属内ＡＡ基因组特异的串联重复序列。序列分析表明，ｐＯｓ１３９以３５５ｂｐ为一重复单位。以ｐＯｓ１３９为探针对２９份中国普通野生稻和４３份中国栽培稻的基因组ＤＮＡ进行的分子杂交表明，籼、粳亚种之间具有明显的差异，籼稻杂交带数明显多于粳稻，普通野生稻与籼稻相似，具有较多的杂交带数。拷贝数测定结果表明，ｐＯｓ１３９在普通野生稻和籼稻中丰度均较高，在粳稻中丰度较低。结合ｐＯｓ１３９的Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交结果和以前的ＲＡＰＤ结果，认为籼稻和粳稻共同起源于普通野生稻。