PTPRA在血源性丙型肝炎病毒感染胎肝干细胞中的作用

摘要

目的采用核素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,i TRAQ)蛋白组学技术发现并鉴定血源性丙型肝炎病毒(blood borne hepatitis C virus,bb HCV)感染人胚胎肝干细胞(human fetal liver stem cells,h FLSCs)的新关键因子。方法按照bb HCV感染与否以及感染后不同时间点将细胞分为5组,去除各组细胞裂解后的高丰度蛋白,运用纳升液相色谱仪(LC-ESI-MSMS)发现并鉴定差异表达蛋白,并对差异表达蛋白进行生物信息学分析,最后对所鉴定出的蛋白利用RT-q PCR和Western blot进行验证。结果对各个时间点的对照组和感染组间进行差异蛋白富集分析,得到bb HCV感染h FLSCs过程中表达差异蛋白PTPRA。针对鉴定的蛋白PTPRA,利用RT-q PCR和Western blot检测发现bb HCV感染后其表达明显升高;利用小RNA技术干涉PTPRA可以降低病毒进入细胞的量。结论 PTPRA可能在bb HCV感染侵入h FLSCs和子代病毒分泌过程中发挥着重要的作用。