辽宁省甲1亚型流感病毒HA1基因变异分析

摘要

目的了解2000～2006年辽宁省甲1亚型流感病毒HA1基因变异特征。方法利用辽宁省流感监测的咽拭分离株中的甲1亚型流感病毒核酸，采用逆转录-聚合酶链反应（RT—PCR）扩增，测序，并推导出其氨基酸序列，进行基因进化特征分析。结果辽宁省2000～2002年均分离到甲1亚型流感病毒，但消失了近3年后，2005年底又出现，且基因序列碱基发生变异，与2005年以前的病毒株和疫苗株A／New Caledonia／20／1999比较，在其HA1蛋白分子上存在有4个氨基酸位点（187位W〉R，188位Y〉F，209位Q〉K，249位V〉A）发生了替换。基因序列及氨基酸序列同源性均有下降。结论辽宁省2000～2006年甲1亚型流感病毒基因序列发生了明显变异，与甲1亚型疫苗株A／New Caledonia／20／1999同源性有下降趋势，提示其抗原可能发生部分漂移或更换，这对流行季节疫苗选择和流行病学研究都具有重要意义。