长雄野生稻(Oryza longistaminata)全基因组Fosmid文库构建

摘要

长雄野生稻（0．10ngistaminata）起源于非洲，具有和亚洲栽培稻相同的AA基因组，是栽培稻改良的重要遗传资源。本研究构建了长雄野生稻全基因组fosmid文库，共获得33．6万克隆，文库的平均插入片段大小约为40kb，其中94．7％的克隆插入片段大小在30～50kb之间。挑取其中约11万克隆并保存，可覆盖10倍栽培稻基因组，对任意基因或序列的筛选概率达到了99．99％。将剩余的22万个克隆进行了末端配对测序，显示其有助于长雄野生稻全基因组测序的拼接。所构建的fosmid文库为筛选和克隆长雄野生稻的有利基因提供了研究材料。