扬州地区乙型肝炎病毒基因型分布及S基因变异分析

摘要

为明确扬州市乙型肝炎病毒基因型分布和S基因特征及突变,从乙型肝炎病毒核酸(HBV DNA)荧光PCR检测855例阳性样本中随机抽取24例,扩增HBV S基因并测序成功获得17个条带,采用Clustal W与HBV A～H基因型参考序列比对构建距离矩阵,用MegAlign比对突变位点,分析氨基酸替代对抗原性的影响,用Protean软件分析主蛋白二级结构。结果表明:17个条带分别位于基因进化树的B和C基因型分支上,其同源性为93.0%～100%。基因B型间同源性93.3%～100%,C型间同源性93.0%～99.8%,同基因型间的同源性最高,与基因A型的同源性最低41.2%。17例样本主蛋白有8例发生氨基酸突变,有11个突变位点,在α决定簇环1中有2个突变位点AAI(126)T和AAF(134)L,其他变异位点位于核膜中。变异表现为点突变,发生突变的氨基酸极性和主蛋白二级结构未改变。这一研究提示扬州市HBV流行以B和C基因型为主,同源性高,突变率较低,未发现突变优势株,病毒表面蛋白的主蛋白抗原性未改变。