扬州地区乙型肝炎病毒不同基因型C基因区特征及突变分析

摘要

目的:研究扬州地区乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)C基因区的基因特征,分析不同基因型间突变差异,为临床提供参考.方法:扩增HBV核酸C基因区并测序,Clustal W比对构建距离矩阵,MegAlign比对突变位点,分析不同基因型间核苷酸同源性和相似度;比较不同基因型间突变比例和突变频率间的差异,分析引起血清转换的突变.结果:测序成功31条序列,基因B型20例,C型11例,总突变率为77.4％,同源相似度分别为:96.1％～99.7％和98.1％～100.0％;基因B型有2例核苷酸G1896A和G1899A联合突变;氨基酸替换频率分别为:8.7/序列、3.3/序列;不同基因型突变比例和氨基酸替换频率的差异有统计学意义(χ2=5.10,P=0.023,95％CI:1.14～49.26;χ2=21.65,P<0.001,95％CI:1.816～4.650).结论:扬州地区HBV C基因区同源相似度高,遗传距离小;HBV突变率高,存在产生血清学转换的核苷酸联合突变株,对病毒免疫学检验产生影响.