穿龙薯蓣、黄山药和盾叶薯蓣psbA-trnH片段序列分析

摘要

为研究薯蓣叶绿体psbA-trnH片段遗传多样性，探讨该片段用于中药穿龙薯蓣、黄山药和盾叶薯蓣种间分子鉴别和系统学研究中的意义，我们对不同类群薯蓣种的叶绿体psbA-trnH基因间区进行PCR扩增并测序，获得了该区间的完整序列，所得序列用软件MEGA3．0进行相关分析．穿龙薯蓣的psbA-trnH片段全长274bp，黄山药全长279bp，盾叶薯蓣植物个体内的叶绿体DNA则有两种psbA-trnH片段，长度分别为241bp和503bp．经MEGA3．0软件分析，3种薯蓣种间psbA-tmH片段序列的遗传距离（p-distance）为0．00350—0．04545，各个薯蓣种内的不同类群该序列无差异．用UPGMA法根据psbA-trnH序列的遗传距离建立系统发生树，聚类结果和形态分类相符．所得结果显示，psbA-trnH片段序列在所研究的3种薯蓣种内保守，在种间具有明显的较大差异，而3种薯蓣及薯蓣属的系统发生关系尚须进一步研究．