水稻种子耐贮性QTL qSS-9的精细定位

摘要

[目的]在前期研究中,我们利用Koshihikari/Kasalath//Koshihikari衍生获得的回交重组自交系(backcross-inbred line,BIL)群体和染色体片段置换系(chromosome segment substitution line,CSSL)群体检测到1个控制种子耐贮性的QTL q SS-9。本研究在此基础上对q SS-9进一步进行定位分析。[方法]利用以‘Koshihikari’为背景、携带q SS-9的‘Kasalath’染色体片段置换系SL226,在多年环境下采用人工老化和自然老化两种处理方法,验证q SS-9的真实存在及稳定性;利用‘Koshihikari’×SL226构建的272个单株组成的F2分离群体对q SS-9进行遗传解析,同时,在F2分离群体中筛选出4个不同的交换单株,构建4个携带有不同长度‘Kasalath’片段的小片段置换系,对q SS-9进一步精细定位。[结果]含有q SS-9增效等位基因的置换系SL226在多年环境中老化处理后的种子发芽率均显著高于‘Koshihikari’;利用Windows QTL Cartographer 2.5软件在F2群体中检测到q SS-9,位于第9染色体标记RM7390与L9-13之间,LOD值为30.94,对表型变异的贡献率为44.02%;4个携带q SS-9的小片段置换系在人工老化处理后的种子发芽率均显著高于‘Koshihikari’。[结论]q SS-9定位在Indel标记Y7与Y13之间,该区间在‘Nipponbare’基因组上的物理距离约为478 kb。本研究为开展水稻耐贮性相关基因的克隆和耐贮性的遗传改良提供了理论基础。