猪圆环病毒2型湖南株的分离及全基因组序列分析

摘要

为了解湖南省猪圆环病毒2型（PCV2）的来源及与其他地区毒株的关系，从湖南省疑患断奶仔猪多系统衰竭综合征（PMWS）猪群中分离PCV2毒株1株（PCVHunan），提取病毒DNA，进行PCR扩增，扩增产物经克隆与酶切鉴定，获得1．7kb片段的阳性重组质粒，对其进行全基因组测序分析．与Genbank中已知全基因组序列进行同源性比较。结果，该序列与国内外毒株核苷酸同源性为93．0％-97．7％，其中与美国株（AR145609）及澳大利亚株（AY424405）同源性最高，为97．7％。2个主要阅读框（ORF1与ORF2）氨基酸序列与国内外毒株同源性分别为98．4％-99．4％和88．0％～95．7％。