基于微卫星技术的赣南脐橙溃疡病菌遗传多样性分析

摘要

在赣南18个县（市、区）收集到508份柑桔溃疡病菌样品，采用已报道的柑桔溃疡病菌A菌系306菌株（GenBankAccessionno．AE008923）基因组上的14个SSR位点分析遗传多样性。从14个SSR位点中，筛选出用于赣南地区溃疡病菌种群多样性研究的SSR位点7个（XL1、XL2、XL3、XL4、XL5、XL8和XL7），测试得到的Nei’s基因多样性指数在0．66-O．83之间。通过这7个位点分析赣南不同地域的样品发现，大余县样品的遗传多态性最高，定南县样品的遗传多态性最低。采用Structure3．25和PowerMarker2．3．4软件聚类分析发现，赣南18县（市、区）的柑桔溃疡病菌样品分成两个组群，且某些县（区）群体结构构成单一。其中，信丰、定南和章贡区样品群体属于同一组群，兴国和会昌样品群体属于另一组群，其他县（区）样品群体则是由两个组群菌株按不同比例混合构成。