最小Hamilton路算法在蛋白质结构预测中的应用

史小红; 许进; 殷志祥; 崔觉梅

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最小Hamilton路算法在蛋白质结构预测中的应用

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本文对蛋白质loop结构进行了反向研究,即对由n个残基构成的loop已知其空间结构,求匹配的n个氨基酸残基序列.把loop的3D信息转化为一个加权完全图Kn模型,然后求加权Kn图的最小Hamilton路.这条H路对应与寻找一个氨基酸残基序列,使该序列能够折叠成这个立体结构模型.根据Bayesian定律得到一个加权表,应用对loop的预测问题,取得预期的结果.

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来源
《生物数学学报》|2009年第1期|171-176|共6页
作者
史小红; 许进; 殷志祥; 崔觉梅;
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作者单位

西安工业大学数理系;

北京大学信息科学技术学院;

华中科技大学控制与系统工程系;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类生物大分子的结构和功能;蛋白质;
关键词
最小Hamilton路; 蛋白质Loop结构; 序列顺序; 加权完全图;

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