蔷薇科植物DELLA蛋白的生物信息学分析

摘要

为探索蔷薇科植物DELLA蛋白的结构特征和亲缘进化关系,以蔷薇科植物苹果、梨和玫瑰等19个DELLA蛋白为试材,利用expasy、PSORT和PROSITE数据库、TM-HMM方法、SignalP4.0Server、CDD、DNAMAN和MEGA version5.3等软件对蛋白质进行了生物信息学分析。结果表明:蔷薇科植物中19个DELLA蛋白氨基酸序列组成成分和理化性质差异不明显,均为非跨膜类亲水性蛋白,且不含信号肽;不同DELLA蛋白之间同源性较高,达到74.38%以上,具有DELLA和GRAS2个保守结构域,功能位点是GRAS;19个DELLA蛋白N端同源性较低,但是存在TVHYNP、VHIID和RVER等DELLA蛋白典型结构域;进化树显示梨属和蔷薇属属内植物DELLA蛋白亲缘关系较近,苹果属内植物亲缘关系相差较远。本研究的开展为蔷薇科植物遗传演化研究提供理论依据。