食管癌高表达抗原HLA-A2/A3限制性细胞毒性T淋巴细胞表位预测

摘要

目的预测食管癌普遍高表达蛋白COX-2和MAGE-4的HLA-A2/A3限制性CTL表位。方法运用生物信息学的方法,SYFPEITHI初步预测,结合三维构效定量关系和蛋白酶体酶切位点分析。结果对SYFPEITHI预测>20的九肽用MHCPred和NetChop3.0作进一步分析,并与已报道抗原肽进行比对,初步筛选出了42个潜在的CTL表位。结论这42个九肽均未见文献报道,进一步鉴定将为CTL表位疫苗的研究提供更多的线索。其中,MAGE-422-30、202-210、286-294及COX-2479-4874个九肽具有与HLA-A2和HLA-A3超型潜在的交叉免疫活性,将为研制简约的高效广谱食管癌疫苗提供候选肽。