腺病毒4型E3区核苷酸序列测定及其基因结构与功能分析

摘要

本文将Ａｄ４基因组相当于７３．３—８９．２基因图谱单位（ｍ．Ｕ．）则的ＤＮＡ片段进行了序列测定及基因结构分析，它包括了Ａｄ４Ｅ３区全基因及该区两侧的部分序列。序列分析表明，Ａｄ４Ｅ３区从ＴＡＴＡＡｂｏｘ起至该区基因结束共４７７８ｂｐ，编码１１个大于６ｋＤ的开放读码框架（ＯＲＦ）。对Ａｄ４Ｅ３区ＯＲＦ分析结果表明，Ａｄ４Ｅ３区编码的１９．３ｋ、１５ｋ和１０．４ｋ蛋白，分别与Ａｄ２Ｅ３区的ｇｐ１９ｋ、１４．７ｋ和１０．４ｋ蛋白相对应，具有非常相似的结构。Ａｄ４Ｅ３区全基因组ＤＮＡ与Ａｄ２和Ａｄ３Ｅ３区ＤＮＡ具有较高的核苷酸同源性，分别为５０％—５５％和５５％—６０％，这一数值大大超过了Ａｄ４全基因组ＤＮＡ与其他亚属的同源性（４％—２３％）。从以上分析可以看出，尽管腺病毒Ｅ３区为非必需区，但在不同型别的腺病毒中都保留着这一区域，而且具有相似的基因结构特征和较高的同源性，说明Ｅ３区在腺病毒自然感染中发挥重要作用。