基于genetool和spss软件对PFGE图谱进行比对的方法

摘要

[目的]建立一种计算机图谱比对方法代替专用分析软件,以满足大量图谱的比对,采用扫描和电脑分析,准确、快速地识读和比较基因组的变异情况,从而识别特异的菌株,提高病原菌的检测效率。节省购买专业比对软件的高额费用。[方法]利用标准分子量、genetool软件和spss软件为基础,先将图像条带结果转化为数值结果,然后将条带比对,转化为数值比对的pearson相关分析,对不同血清型的沙门氏菌的PFGE图谱条带进行计算机分析。[结果]在输出的聚类树状图、相关矩阵两方面的数据分析都与肉眼比对分析结果完全相同。[结论]建立的计算机比对方法可很好的代替专用比对软件,满足大量PFGE图谱的比对分析。且准确、快速。