广东地区人禽流感H_5N_1血凝素基因特征与进化

摘要

目的通过对广东地区人禽流感H5N1毒株（HA）基因序列的变异分析，揭示毒株HA基因变异与进化。方法对广东地区人禽流感H5N1毒株（A／GD／01／06）HA基因测序，同时检索全球各地人禽流感H5N1毒株HA基因，采用SPSS11．0和DNAStar5．0软件对检索的人禽流感H5N1毒株HA基因核苷酸序列进行聚类、比对和分析；并结合临床资料对变异毒株进行进化速度分析。结果1997～2006年，42毒株HA基因序列聚类分成3类；HA基因89氨基酸位点置换，占15．7％（89／568）；2003～2006年H5N1，毒株通过氨基酸第170～172位（NST／S）位点的置换，增加一个糖基化位点。同义变异中，HA基因Ks为1．99×10^-5～2．58×10^-5,生物进化线性回归方程为Y=4．8×10^-9X＋1．048×10^-5；同时各毒株Ks均大于Ka，进化检验Ks／Ka值显示HA基因进化压力主要来自自然变异。42株地N1毒株可以分3条进化途径，1997-1998年毒株为1条，2003～2005年东南亚毒株为第2条途径，2005～2006年中国毒株为第3条途径。毒株HK-213-03氨基酸变异显示其变异的进化过度性，而2004年毒株TL—L2004—04氨基酸位点变异值得注意。结论2003--2006年人禽流感H5N1毒株HA基因抗原性与1997年毒株有较大不同，人禽流感H5N1，毒株增加一个糖蛋白位点可能改变毒株致病性；少数毒株氨基酸位点变异较大，值得关注。人禽流感H5N1毒株在自然界变异频繁，但受到鸟禽和人体的免疫压力较小；但随着H5N1，毒株自然进化，H5N1，毒株具有人一人传播能力的概率较大。建议在研制人禽流感H5N1毒株疫苗时，要充分考虑不同毒株HA基因抗原性。