噪声性听觉损伤易感豚鼠差异表达基因的筛选与分析

摘要

目的利用抑制消减杂交技术(SSH)筛选分析噪声性听觉损伤易感与不易感豚鼠耳蜗差异表达基因。方法易感组与不易感组豚鼠耳蜗组织利用Trizol法分别提取总RNA;SmartTM技术分别合成cDNA;SSH筛选差异表达基因,并进行测序和生物信息学分析。结果筛选噪声性听觉损伤(NIHL)易感与不易感豚鼠耳蜗的明显差异表达基因片段148条,包括易感组豚鼠耳蜗表达上调73条和下调75条。同源性大于80%且匹配碱基大于100 bp的相关序列共34条,其中上调7条,包括多聚泛素基因、β珠蛋白和α珠蛋白等;下调27条,包括线粒体基因组(mtDNA)、热休克蛋白(HSP)和细胞周期非特异性因子1等。结论SSH是一种高效的筛选差异表达基因的方法,mtDNA和HSP与NIHL及其易感性的发生相关。