长江口邻近水域刀鲚的线粒体控制区序列变异与遗传多样性

摘要

经克隆测序获得了采自长江口九段沙、钱塘江口、舟山等3个地点35尾刀鲚（Coilia nasus）的mtDNA控制区全序列,分析了控制区序列的变异和遗传结构。结果显示,长江口邻近水域刀鲚的mtDNA控制区序列具有长度多态性,全长为1214-1291bp,主要是在第358位点处有以“CTA TGT ATT ATA TTA CAT ATA TTA TGG TAT AGT ACA TA”38bp为单位的1-2次片段重复。种群遗传结构分析显示,长江口邻近水域刀鲚的平均单倍型多样性（h）为0.9983,3个群体的平均核苷酸多样性（π）为0.0262,表现出丰富的遗传多样性和较高的进化潜力。3个刀鲚群体间的分化指数FST仅为0.012-0.053,而基因交流值Nm却达9.90-40.62。群体间K2-P遗传距离与AMOVA分析结果也表明,长江口及毗邻地区的刀鲚没有发生地理分化。以线粒体DNA控制区全序列构建的NJ树揭示,3个群体的个体组成了2个谱系,但这2个谱系与地理分群并不相关。依据分子钟理论,推测这两个谱系的分化发生在更新世末期。