硒蛋白P的结构与功能预测

摘要

目的　预测硒蛋白P的结构和功能。方法　利用生物信息学方法分析硒蛋白P的氨基酸疏水性、跨膜螺旋、二硫键的形成、氨基酸残基相对可及性和二级结构的组成及外显子对应的肽序列 ,利用Smith Waterman法在EMBL蛋白数据库中对硒蛋白P进行同源性比对 ,ScanProsite程序在PROSITE数据库中搜索硒蛋白P中的基序 ,SMART服务器搜索结构域。结果　成熟的硒蛋白P有两个跨膜螺旋 ,由四个模块组成 :M1(Glu2 0 Ser6 7 Lys6 8)、M2 (Ser6 7 Lys6 8 Asp138 Arg139)、M3(Asp138 Arg139 Thr178) ,和M4 (Thr179 Asn381) ;在M2中有一螺旋的螺旋结构 ,其中的规则二级结构高于其他三个模块 ,在M1、M3、M4中环形 (loop)结构含量较高 ,M4含有富含组氨酸的序列 (His2 0 4 His2 5 7)且该序列位于硒蛋白P的表面 ;氨基酸溶剂可及性分析表明成熟的硒蛋白P不是球形结构。几种在脑的发育中起重要作用的蛋白HUNBSCAAL、ZP12BRARE、BR11BRARE ,和BRN1HUMAN与硒蛋白P有同源性 ,这种同源性可能是对脑的特异性 ;另外两个同源性蛋白是KNOBPLAFG和HPNHELPY ,KNOBPLAFG能锚定于内皮细胞受体与血小板反应蛋白形成的复合物上 ,而HPNHELPY对镍和锌有强烈的结合特性。结论　硒蛋白P有金属结合活性及与内皮细胞的重要关系 ,结果还显示硒蛋白P对脑的?