不同化疗敏感性下咽鳞癌差异基因表达谱的筛选

摘要

目的筛选化疗敏感性不同的下咽鳞癌差异基因表达谱,探讨基因表达谱预测下咽鳞癌化疗敏感性的可能性。方法选取诱导化疗敏感和不敏感的下咽鳞癌各4例,分别提取mRNA,体外反转录为cDNA和cRNA,不同生物素标记和片断化后制成cRNA探针,与人类基因组芯片杂交,对杂交信号扫描并归一化处理,使用GCOS4.0统计软件分析。以Signal Log Ratio≥1和change P-value≤0.05为标准筛选差异表达基因并根据生物学过程和功能分类。结果筛选差异表达基因119条,其中上调基因65条,下调基因54条。差异表达基因包括信号传导(STAT3),细胞周期(CCND1、TCF7L1),细胞凋亡(FADD),黏附分子(MUC4、cadherin 11、ICAM2)以及酶类等,化疗敏感组中EGFR、TGF-β和TNFR等细胞信号通路异常。结论不同化疗敏感性的下咽鳞癌基因表达谱不同,根据基因表达谱的变化评估化疗敏感性是可能的。