浙江省流行性感冒病毒分离株HA1基因分析

摘要

目的 研究浙江省近2年新分离的甲3型流行性感冒（流感）病毒株血凝素HA1基因特性，以了解浙江省流感病毒变异情况和WHO推荐疫苗株对人体的保护情况。方法 采集浙江省近2年类流感病人的咽拭子和含漱液标本进行流感病毒的分离，对分离到的甲3型流感病毒进行核酸的提取，采用逆转录一聚合酶链反应（RT-PCR）扩增病毒基因后进行核苷酸序列测定，用DNAMAN和BioEdit生物软件对测序结果进行分析处理，并与WHO推荐疫苗株进行比对。结果 近2年新分离到的甲3型流感病毒株HA，区域的核苷酸序列长度均为987bp，未发现核苷酸的丢失和插入，相应的点突变率为0．8％～1．3％，推导的氨基酸序列长度均为329个。2003年分离的毒株与同期WHO推荐使用的疫苗株A／Moscow／10／99比较，核苷酸同源性只有95．6％～95．9％，氨基酸总变异达20个，发生在抗原决定簇A、B区的有6个位点。2004年分离的毒株与同期WHO推荐使用的疫苗株A／fujian／411／2002（A／Kumamoto／102／2002，A Wyoming／3／2003）比较，核苷酸同源性达98．6％～99．1％，仅发生3～6个氨基酸的变异。基因进化树上，浙江省2003，2004年新分离的毒株均属于同一类性状的毒株，与2004年WHO推荐疫苗株接近．已远离2003年推荐疫苗株。结论 浙江省甲3型流感病毒的抗原性已发生漂移，与我省流感的流行密切相关。2003年WHO推荐使用的甲3型流感疫苗对我省甲3型流感的预防效果不够理想，2004年推荐使用的疫苗对我省甲3型流感的预防效果较好。