牙鲆淋巴囊肿病毒中国株(LCDV-C)羟类固醇脱氢酶基因的特征分析

摘要

属于虹彩病毒科的淋巴囊肿病毒(Lymphoeystisdiseasevirus,LCDV)是一类能引起全球各地上百种淡、海水鱼产生囊肿的病原。在新分离到淋巴囊肿病毒中国株(LymphocystisdiseasevirusisolatefromChina,LCDV—C)并完成序列测定的基础上,用计算机辅助分析了LCDV—C羟类固醇脱氢酶(hydroxysteroiddehydrogenase,HSD)基因结构特征,LCDV—CHSD读码框为1023bp,推导其编码含340个氨基酸、分子量约为39.3kD的蛋白质。对来自10个不同病毒株或物种的HSD蛋白序列进行的比较分析显示,LCDV-C与淋巴囊肿病毒代表株(LCDV-1)的HSD氨基酸同源性最高,为60.5%。对LCDV-CHSD的二级结构进行了预测,有亲水区5个,抗原区、α螺旋区和β折叠区各有6个。经密度排列界面(densealignmentsurface,DAS)的方法预测,表明LCDV-CHSD有一个跨膜结构域。