探讨rDNA ITS区作为果蝇Drosophila nasuta分子系统发育研究的价值

摘要

测定了果蝇ｎａｓｕｔａ亚群７个分类元和外群Ｄ ．ｉｍｍｉｇｒａｎｓ的核糖体基因转录间隔区 （ＩＴＳ， ｉｎｔｅｒｔｒａｎｓｃｒｉｂｅｄ ｓｐａｃｅｒ），包含５．８ＳｒＤＮＡ和２Ｓ ｒＤＮＡ长约１．１ｋｂ的ＤＮＡ片段序列。结 果表明：Ｄ．ｐａｌｌｉｄｉｆｒｏｎｓ、Ｔａｘｏｎ　Ｌ Ｔｕｏｎ　Ｊ享有共同的序列；Ｄ．ａｌｂｏｍｉｃａｎｓ则与Ｄ．ｓ． ｎｅｏｎａｓｕｔａ共享１个序列。序列之间存在少量的插入缺失和碱基替代。其中插入和缺失主要发 生内外群之间，内群中只有Ｄ．ｎｉｖｅｉｆｒｏｎｓ发生１个碱基的插入和１２个碱基的缺失以及Ｄ．ｓ． ｓｕｌｆｕｒｉｇａｓｔｅｒ序列中１个碱基的缺失；而在包括外群在内的碱基替代中，共有５５次转换，６５次 颠换，转换／颠换值与动物线粒体基因组十分不同。采用简约法和邻接法构建这７个分类元 的系统发育关系。发现 Ｄ．ｎｉｖｅｉｆｒｏｎｓ位于树的基部，与其他物种有较远的亲缘关系；Ｄ． ａｌｂｏｍｉｃａｎｓ、Ｄ． ｓ． ｎｅｏｎａｓｕｔａ、Ｄ． ｐａｌｌｉｄｉｆｒｏｎｓｓ、Ｔａｘｏｎ　Ｉ、Ｔａｘｏｎ Ｊ最接近，它们是亲缘关系最近的种类。讨论了Ｄ．ｓ．ｓｕｌｆｕｒｉｇａｓｔｅｒ和Ｄ ．ｓ． ｎｅｏｎａｓｕｔａ相互接?