谢瓦氏曲霉间型变种YchF基因cDNA全长克隆及序列分析

摘要

从谢瓦氏曲霉间型变种抑制性差减杂交(SSH)文库中,筛选到一个子囊孢子时期差异表达的序列标签A0128.860,以其序列为模板设计特异性引物,利用RT-PCR及RACE技术克隆获得了该基因的全长cD-NA,命名为eYchF。生物信息学分析显示,该基因包含一个1182bp的完整开放阅读框(ORF),编码393个氨基酸,相对分子质量为43.4669kD,预测的理论等电点为6.99,包括一个保守的G domain(guanine nucleotide-binding domain)和一个TGS(ThrRS,GTPase,Spo T)domain,为疏水蛋白。序列同源性分析表明:该基因与棒曲霉(Aspergillus clavatus NRRL1)的GTP结合蛋白YchF相似度为84%,谢瓦氏曲霉间型变种YchF基因的克隆及生物信息学分析为YchF的进一步研究奠定了基础。