Survivin HLA-A2^+高亲和性CTL表位的预测及鉴定

摘要

目的:采用生物信息方法预测和鉴定survivin抗原HLA-A2+限制性CTL表位,为探索基于survivin的肿瘤免疫治疗奠定基础。方法:采用超基序法和量化基序法对靶抗原survivin HLA-A2+限制性CTL表位进行预测;选取得分>10的表位肽为候选对象,并进行人工合成。采用T2细胞,以HLA-A2结合实验和流式细胞术(FITC染色)检测候选CTL表位肽的结合亲和力[以荧光系数(fluorescence index,FI)表示];以HLA-A2解离实验和流式细胞术检测其结合稳定性[以复合物解离50%的时间DC50(dissociation complex50%)表示]。结果:预测到的候选survivinCTL表位肽分别是:20STFKNWPFL28(SV20-28)、23KNWPFLEGC31(SV23-31)、96LTLGEFLKL104(SV96-104)、6LPPAWQPFL14(SV6-14)、33CTPERMAEA41(SV33-41)、46CPTE-NEPDL54(SV46-54)、130KVRRAIEQL138(SV130-138)、37RMAEAGFIH45(SV37-45)、88SVKKQFEEL96(SV88-96)。亲和力分析显示:SV20-28、SV96-104、SV130-138、SV23-31的FI分别为8.61、6.88、5.89、3.81;SV33-41、SV6-14、SV46-54、SV37-45、SV88-96的FI分别为0.31、-0.29、-0.4、-0.16和-0.03;稳定性分析结果DC50为:SV20-28、SV96-104、SV130-138>8h;SV23-31为4～6h;SV6-14、SV33-41、SV88-96为2～4h;SV46-54、SV37-45为0～2h。结果提示,SV20-28、SV96-104、SV130-138为高亲和力表位肽,SV23-31为中等亲和力表位肽,SV33-41、SV6-14、SV46-54、SV37-45、SV88-96为低亲和力表位肽。结论:超基序法、量化基序法可快速有效地预测抗原表位,SV20-28、SV96-104、SV130-138有可能是survivin HLA-A2+CTL表位,可用于后续研究。