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从时间序列基因芯片数据中挖掘跨事务关联规则

     

摘要

目的探讨从时间序列基因芯片数据中发掘基因之间的作用关系。方法采用跨事务关联规则挖掘技术及Gene Ontology标注库对时间序列基因芯片数据进行分析处理。结果根据6个不同发育时间段的基因芯片表达数据,采用2倍法从10080个探针中筛选出119个差异表达基因参与规则挖掘,产生的规则达1300多条,筛选保留J-Measure值最大的10条关联规则并构建基因关联网络图。结论跨事务关联规则能够描述时序基因之间的作用关系,根据关联规则可以对基因的表达状态进行预测。

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