基于生物信息学分析方法设计HSV-1诊断芯片的通用寡核苷酸探针

摘要

目的：设计单纯疱疹病毒1型（HSV-1）诊断芯片的寡核苷酸（Oligo）探针;方法：利用BLAST软件对HSV-1的基因序列进行对比,得出对设计HSV-1探针有意义的特异序列,并通过生物学软件Oligo 6.0设计特异性高Tm值相近、长度均一的Oligo探针;结果：获得在相同的杂交、清洗条件下可得到最佳杂交效果的10条30-mer的Oligo探针;结论：通过生物信息学方法设计出HSV-1诊断芯片的探针,可为后期制备成基因芯片,为进行HSV-1的检测打下良好的基础。