食管鳞癌、贲门腺癌和结肠腺癌高频突变基因谱比较

摘要

目的通过对比分析食管鳞癌、贲门腺癌和结肠腺癌高频突变基因,确定3种肿瘤间主要变异基因。方法采用全基因组外显子测序方法对98例结肠腺癌检测分析,将结肠腺癌中的高频突变基因在109例食管鳞癌和112例贲门腺癌中进行靶向测序,确定食管鳞癌、贲门腺癌和结肠腺癌三者共同存在或者特异的基因改变。结果黏蛋白16(mucin16,MUC16)、丝聚蛋白(filaggrin,FLG)、SMAD家族4(SMAD family member 4,Smad4)和Ⅵ型胶原蛋白α3(collagen typeⅥalpha 3 chain,COL6A3)在食管鳞癌、贲门腺癌和结肠腺癌组织中均存在不同程度的突变,突变类型均以错义突变为主。其中,MUC16和COL6A3基因在3种肿瘤组织中的突变频率非常相似,MUC16基因突变率分别为21.1%、27.7%和18.4%,COL6A3基因突变率分别为4.6%、10.7%和10.2%。而SMAD4基因在食管鳞癌和贲门腺癌的突变频率低于结肠腺癌(0.9%vs 4.5%vs 14.3%,P<0.05),FLG基因在食管鳞癌中的突变频率高于贲门腺癌和结肠腺癌(22.9%vs 9.8%vs 6.1%,P<0.05)。结论MUC16和COL6A3基因突变可能是食管鳞癌、贲门腺癌和结肠腺癌3种不同组织来源肿瘤共同存在的分子改变,而FLG和SMAD4基因突变则分别与食管鳞癌和结肠腺癌的发生密切相关。