基于核基因序列JRD5680的核桃群体遗传多样性和遗传结构研究

摘要

以40个核桃(Juglans regia)地理群体及5个外类群植物为材料,利用苯丙氨酸解氨酶基因片段JRD5680序列对265个个体研究了我国不同地区核桃的群体遗传多样性、群体遗传结构以及单倍型地理分布。结果表明:核基因JRD5680序列长度为809 bp,其中G+C碱基含量为46.2%,74个简约性信息位点。共30个单倍型,单倍型多样性变异小,表现出较低的遗传多样性(H_d=0.370,π=0.005 3)。核桃群体间有明显的谱系地理学结构(N_(ST)>G_(ST)),呈现地域性分布格局的特点。空间遗传结构分析表明,地理隔离距离与遗传距离之间也显示两者之间相关性显著(r=0.263 2;P=0.032 4*),不同地理分布核桃群体间存在着明显地理隔离效应。综合失配分析及中性检验的结果,可推断出近期历史上不同地区核桃没有发生群体扩张事件。遗传结构显示,核桃群体可分为两组(西南地区与其他地区)。AMOVA分析结果表明,核桃群体遗传变异主要存于群体之间(56.54%),不同种之间的遗传分化水平较高(F_(ST)=0.885)。单倍型系统发育树中核桃与外类群物种均能形成单系分支,说明JRD5680序列在胡桃科中的具有较高的分子鉴别率。